Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
SS18Q15532 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SS18Q15532 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SS18Q15532 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SS18Q15532 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SS18Q15532 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SS18Q15532 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SS18Q15532 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SS18Q15532 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SS18Q15532 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SS18Q15532 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SS18Q15532 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SS18Q15532 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SS18Q15532 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SS18Q15532 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SS18Q15532 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SS18Q15532 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SS18Q15532 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SS18Q15532 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SS18Q15532 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SS18Q15532 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SS18Q15532 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SS18Q15532 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SS18Q15532 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SS18Q15532 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SS18Q15532 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SS18Q15532 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SS18Q15532 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SS18Q15532 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SS18Q15532 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SS18Q15532 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SS18Q15532 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SS18Q15532 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SS18Q15532 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SS18Q15532 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SS18Q15532 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SS18Q15532 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SS18Q15532 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SS18Q15532 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SS18Q15532 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SS18Q15532 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SS18Q15532 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SS18Q15532 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SS18Q15532 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SS18Q15532 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SS18Q15532 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SS18Q15532 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SS18Q15532 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SS18Q15532 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SS18Q15532 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SS18Q15532 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
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SS18Q15532 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
SS18Q15532 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SS18Q15532 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
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SS18Q15532 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SS18Q15532 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
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SS18Q15532 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SS18Q15532 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SS18Q15532 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC1.09□□□□□ -2.23
SS18Q15532 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SS18Q15532 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SS18Q15532 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SS18Q15532 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
SS18Q15532 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SS18Q15532 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
SS18Q15532 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SS18Q15532 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
SS18Q15532 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.23
SS18Q15532 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SS18Q15532 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SS18Q15532 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SS18Q15532 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
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