Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
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