Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC3.68□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC3.68□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
UBE3CQ15386 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.5 ms