Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.4 ms