Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
EEA1Q15075 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
EEA1Q15075 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
EEA1Q15075 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
EEA1Q15075 U6.48-201ENST00000618523 106 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
EEA1Q15075 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
EEA1Q15075 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC-0.18□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 SNORA32.1-201ENST00000364514 115 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 LINC02552-203ENST00000545630 583 ntTSL 2 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 AP002371.1-201ENST00000463604 433 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 RNU6-491P-201ENST00000516099 110 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
EEA1Q15075 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.5 ms