Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KARSQ15046 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KARSQ15046 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KARSQ15046 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KARSQ15046 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KARSQ15046 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KARSQ15046 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KARSQ15046 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KARSQ15046 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KARSQ15046 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KARSQ15046 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KARSQ15046 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KARSQ15046 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KARSQ15046 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KARSQ15046 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KARSQ15046 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KARSQ15046 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KARSQ15046 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KARSQ15046 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KARSQ15046 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KARSQ15046 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KARSQ15046 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KARSQ15046 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KARSQ15046 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KARSQ15046 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KARSQ15046 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KARSQ15046 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KARSQ15046 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KARSQ15046 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KARSQ15046 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KARSQ15046 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KARSQ15046 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KARSQ15046 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KARSQ15046 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KARSQ15046 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KARSQ15046 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KARSQ15046 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KARSQ15046 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KARSQ15046 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KARSQ15046 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KARSQ15046 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KARSQ15046 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KARSQ15046 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KARSQ15046 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KARSQ15046 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KARSQ15046 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KARSQ15046 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KARSQ15046 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KARSQ15046 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KARSQ15046 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KARSQ15046 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KARSQ15046 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KARSQ15046 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KARSQ15046 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KARSQ15046 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KARSQ15046 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KARSQ15046 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KARSQ15046 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KARSQ15046 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KARSQ15046 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KARSQ15046 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KARSQ15046 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KARSQ15046 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KARSQ15046 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KARSQ15046 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KARSQ15046 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KARSQ15046 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KARSQ15046 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KARSQ15046 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KARSQ15046 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KARSQ15046 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KARSQ15046 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KARSQ15046 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KARSQ15046 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KARSQ15046 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KARSQ15046 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KARSQ15046 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KARSQ15046 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KARSQ15046 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KARSQ15046 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KARSQ15046 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KARSQ15046 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KARSQ15046 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KARSQ15046 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KARSQ15046 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KARSQ15046 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KARSQ15046 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KARSQ15046 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KARSQ15046 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KARSQ15046 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KARSQ15046 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KARSQ15046 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KARSQ15046 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC2.21□□□□□ -2.05
KARSQ15046 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KARSQ15046 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KARSQ15046 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KARSQ15046 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KARSQ15046 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KARSQ15046 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KARSQ15046 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
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