Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

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Length 2,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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