Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
CCINQ13939 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CCINQ13939 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CCINQ13939 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
CCINQ13939 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CCINQ13939 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CCINQ13939 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CCINQ13939 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
CCINQ13939 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
CCINQ13939 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.7
CCINQ13939 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.7
CCINQ13939 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CCINQ13939 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CCINQ13939 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CCINQ13939 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CCINQ13939 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CCINQ13939 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CCINQ13939 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
CCINQ13939 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CCINQ13939 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CCINQ13939 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CCINQ13939 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CCINQ13939 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CCINQ13939 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CCINQ13939 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CCINQ13939 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
CCINQ13939 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
CCINQ13939 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CCINQ13939 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
CCINQ13939 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
CCINQ13939 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
CCINQ13939 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
CCINQ13939 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CCINQ13939 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CCINQ13939 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CCINQ13939 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CCINQ13939 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CCINQ13939 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CCINQ13939 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CCINQ13939 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CCINQ13939 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CCINQ13939 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CCINQ13939 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CCINQ13939 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CCINQ13939 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CCINQ13939 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CCINQ13939 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CCINQ13939 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CCINQ13939 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CCINQ13939 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CCINQ13939 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CCINQ13939 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CCINQ13939 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CCINQ13939 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CCINQ13939 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CCINQ13939 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CCINQ13939 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CCINQ13939 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CCINQ13939 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CCINQ13939 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CCINQ13939 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CCINQ13939 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CCINQ13939 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CCINQ13939 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CCINQ13939 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CCINQ13939 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CCINQ13939 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CCINQ13939 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CCINQ13939 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CCINQ13939 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CCINQ13939 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CCINQ13939 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CCINQ13939 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
CCINQ13939 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CCINQ13939 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CCINQ13939 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CCINQ13939 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CCINQ13939 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
CCINQ13939 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
CCINQ13939 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CCINQ13939 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
CCINQ13939 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
CCINQ13939 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
CCINQ13939 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
CCINQ13939 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CCINQ13939 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CCINQ13939 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CCINQ13939 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CCINQ13939 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CCINQ13939 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CCINQ13939 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CCINQ13939 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CCINQ13939 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CCINQ13939 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CCINQ13939 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CCINQ13939 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CCINQ13939 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CCINQ13939 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CCINQ13939 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CCINQ13939 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.3 ms