Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC0.35□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 AC115989.2-201ENST00000578640 563 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC0.35□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC0.34□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 AC104009.1-203ENST00000531304 571 ntTSL 4 BASIC0.34□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 ETFRF1-208ENST00000556402 874 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC0.34□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 AL118556.2-201ENST00000614375 824 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 AC090617.9-201ENST00000623751 147 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 SPHAR-201ENST00000366688 648 ntAPPRIS P1 BASIC0.33□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC0.33□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC0.33□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 LINC01578-206ENST00000555520 977 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC0.33□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC0.33□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 AC022387.2-201ENST00000604050 448 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.33□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 RNU6-891P-201ENST00000384280 111 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC0.33□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC0.33□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 AC011131.1-201ENST00000521224 252 ntTSL 2 BASIC0.33□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC0.33□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 AC079917.1-201ENST00000527828 584 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 AC103810.2-203ENST00000584959 631 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
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