Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GTF2H3Q13889 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GTF2H3Q13889 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GTF2H3Q13889 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GTF2H3Q13889 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GTF2H3Q13889 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
GTF2H3Q13889 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GTF2H3Q13889 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GTF2H3Q13889 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GTF2H3Q13889 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GTF2H3Q13889 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GTF2H3Q13889 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GTF2H3Q13889 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
GTF2H3Q13889 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GTF2H3Q13889 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GTF2H3Q13889 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GTF2H3Q13889 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GTF2H3Q13889 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GTF2H3Q13889 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
GTF2H3Q13889 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GTF2H3Q13889 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GTF2H3Q13889 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GTF2H3Q13889 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GTF2H3Q13889 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
GTF2H3Q13889 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
GTF2H3Q13889 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
GTF2H3Q13889 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
GTF2H3Q13889 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
GTF2H3Q13889 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
GTF2H3Q13889 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.86
GTF2H3Q13889 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
GTF2H3Q13889 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
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