Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
ALCAMQ13740 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ALCAMQ13740 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ALCAMQ13740 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ALCAMQ13740 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ALCAMQ13740 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ALCAMQ13740 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
ALCAMQ13740 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ALCAMQ13740 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ALCAMQ13740 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
ALCAMQ13740 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ALCAMQ13740 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ALCAMQ13740 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ALCAMQ13740 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ALCAMQ13740 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ALCAMQ13740 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ALCAMQ13740 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ALCAMQ13740 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ALCAMQ13740 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ALCAMQ13740 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ALCAMQ13740 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ALCAMQ13740 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ALCAMQ13740 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
ALCAMQ13740 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ALCAMQ13740 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ALCAMQ13740 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
ALCAMQ13740 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ALCAMQ13740 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ALCAMQ13740 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ALCAMQ13740 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
ALCAMQ13740 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
ALCAMQ13740 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ALCAMQ13740 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ALCAMQ13740 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
ALCAMQ13740 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ALCAMQ13740 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
ALCAMQ13740 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ALCAMQ13740 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ALCAMQ13740 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
ALCAMQ13740 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
ALCAMQ13740 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ALCAMQ13740 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
ALCAMQ13740 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ALCAMQ13740 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
ALCAMQ13740 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ALCAMQ13740 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ALCAMQ13740 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ALCAMQ13740 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ALCAMQ13740 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
ALCAMQ13740 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ALCAMQ13740 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
ALCAMQ13740 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ALCAMQ13740 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ALCAMQ13740 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ALCAMQ13740 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ALCAMQ13740 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ALCAMQ13740 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ALCAMQ13740 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ALCAMQ13740 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ALCAMQ13740 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ALCAMQ13740 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ALCAMQ13740 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ALCAMQ13740 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ALCAMQ13740 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ALCAMQ13740 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ALCAMQ13740 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ALCAMQ13740 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ALCAMQ13740 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ALCAMQ13740 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ALCAMQ13740 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ALCAMQ13740 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ALCAMQ13740 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ALCAMQ13740 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ALCAMQ13740 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ALCAMQ13740 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ALCAMQ13740 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ALCAMQ13740 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ALCAMQ13740 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ALCAMQ13740 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ALCAMQ13740 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ALCAMQ13740 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ALCAMQ13740 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ALCAMQ13740 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ALCAMQ13740 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ALCAMQ13740 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
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ALCAMQ13740 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
ALCAMQ13740 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ALCAMQ13740 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
ALCAMQ13740 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ALCAMQ13740 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
ALCAMQ13740 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ALCAMQ13740 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ALCAMQ13740 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
ALCAMQ13740 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
ALCAMQ13740 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
ALCAMQ13740 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
ALCAMQ13740 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ALCAMQ13740 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ALCAMQ13740 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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