Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
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