Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
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FOXE3Q13461 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
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FOXE3Q13461 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
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FOXE3Q13461 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
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FOXE3Q13461 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
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FOXE3Q13461 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
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FOXE3Q13461 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
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