Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NME3Q13232 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
NME3Q13232 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NME3Q13232 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NME3Q13232 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NME3Q13232 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
NME3Q13232 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NME3Q13232 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
NME3Q13232 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NME3Q13232 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NME3Q13232 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
NME3Q13232 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
NME3Q13232 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NME3Q13232 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NME3Q13232 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NME3Q13232 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NME3Q13232 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NME3Q13232 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NME3Q13232 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
NME3Q13232 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NME3Q13232 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NME3Q13232 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NME3Q13232 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NME3Q13232 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NME3Q13232 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NME3Q13232 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NME3Q13232 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
NME3Q13232 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
NME3Q13232 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
NME3Q13232 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NME3Q13232 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NME3Q13232 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NME3Q13232 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NME3Q13232 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NME3Q13232 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
NME3Q13232 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC2.15□□□□□ -2.07
NME3Q13232 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
NME3Q13232 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
NME3Q13232 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
NME3Q13232 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NME3Q13232 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NME3Q13232 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NME3Q13232 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NME3Q13232 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NME3Q13232 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC2.15□□□□□ -2.07
NME3Q13232 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NME3Q13232 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NME3Q13232 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
NME3Q13232 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NME3Q13232 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NME3Q13232 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NME3Q13232 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NME3Q13232 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
NME3Q13232 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
NME3Q13232 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
NME3Q13232 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
NME3Q13232 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NME3Q13232 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NME3Q13232 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NME3Q13232 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NME3Q13232 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NME3Q13232 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NME3Q13232 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NME3Q13232 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
NME3Q13232 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NME3Q13232 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
NME3Q13232 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
NME3Q13232 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NME3Q13232 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NME3Q13232 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NME3Q13232 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
NME3Q13232 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
NME3Q13232 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
NME3Q13232 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NME3Q13232 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
NME3Q13232 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NME3Q13232 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NME3Q13232 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC2.14□□□□□ -2.07
NME3Q13232 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
NME3Q13232 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
NME3Q13232 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NME3Q13232 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NME3Q13232 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
NME3Q13232 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NME3Q13232 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NME3Q13232 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NME3Q13232 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NME3Q13232 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NME3Q13232 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NME3Q13232 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
NME3Q13232 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NME3Q13232 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
NME3Q13232 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
NME3Q13232 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
NME3Q13232 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NME3Q13232 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NME3Q13232 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NME3Q13232 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NME3Q13232 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NME3Q13232 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
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