Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC1.77□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC1.76□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
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