Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 AL356272.1-201ENST00000454538 832 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC1.07□□□□□ -2.24
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PTPRBP23467 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
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PTPRBP23467 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
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PTPRBP23467 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
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PTPRBP23467 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
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PTPRBP23467 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
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PTPRBP23467 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
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PTPRBP23467 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 MTND1P36-201ENST00000522384 936 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
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