Protein–RNA interactions for Protein: O43615

TIMM44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM44O43615 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
TIMM44O43615 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TIMM44O43615 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TIMM44O43615 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TIMM44O43615 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TIMM44O43615 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TIMM44O43615 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TIMM44O43615 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
TIMM44O43615 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
TIMM44O43615 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
TIMM44O43615 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
TIMM44O43615 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TIMM44O43615 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TIMM44O43615 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
TIMM44O43615 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
TIMM44O43615 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
TIMM44O43615 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TIMM44O43615 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
TIMM44O43615 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TIMM44O43615 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TIMM44O43615 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TIMM44O43615 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TIMM44O43615 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TIMM44O43615 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
TIMM44O43615 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TIMM44O43615 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TIMM44O43615 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TIMM44O43615 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
TIMM44O43615 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
TIMM44O43615 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TIMM44O43615 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
TIMM44O43615 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
TIMM44O43615 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
TIMM44O43615 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TIMM44O43615 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TIMM44O43615 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TIMM44O43615 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
TIMM44O43615 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TIMM44O43615 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
TIMM44O43615 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
TIMM44O43615 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TIMM44O43615 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TIMM44O43615 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
TIMM44O43615 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
TIMM44O43615 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TIMM44O43615 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
TIMM44O43615 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
TIMM44O43615 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TIMM44O43615 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TIMM44O43615 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TIMM44O43615 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TIMM44O43615 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
TIMM44O43615 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TIMM44O43615 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TIMM44O43615 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TIMM44O43615 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TIMM44O43615 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
TIMM44O43615 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
TIMM44O43615 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TIMM44O43615 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TIMM44O43615 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TIMM44O43615 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
TIMM44O43615 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TIMM44O43615 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TIMM44O43615 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TIMM44O43615 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TIMM44O43615 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TIMM44O43615 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
TIMM44O43615 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TIMM44O43615 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
TIMM44O43615 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TIMM44O43615 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TIMM44O43615 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
TIMM44O43615 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TIMM44O43615 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TIMM44O43615 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TIMM44O43615 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
TIMM44O43615 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
TIMM44O43615 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
TIMM44O43615 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TIMM44O43615 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TIMM44O43615 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TIMM44O43615 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TIMM44O43615 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TIMM44O43615 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TIMM44O43615 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TIMM44O43615 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TIMM44O43615 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TIMM44O43615 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TIMM44O43615 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TIMM44O43615 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TIMM44O43615 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TIMM44O43615 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TIMM44O43615 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TIMM44O43615 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TIMM44O43615 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TIMM44O43615 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TIMM44O43615 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TIMM44O43615 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TIMM44O43615 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.3 ms