Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CIPCQ9C0C6 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CIPCQ9C0C6 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CIPCQ9C0C6 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CIPCQ9C0C6 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CIPCQ9C0C6 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CIPCQ9C0C6 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CIPCQ9C0C6 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CIPCQ9C0C6 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CIPCQ9C0C6 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CIPCQ9C0C6 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
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CIPCQ9C0C6 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CIPCQ9C0C6 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CIPCQ9C0C6 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CIPCQ9C0C6 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CIPCQ9C0C6 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CIPCQ9C0C6 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CIPCQ9C0C6 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CIPCQ9C0C6 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CIPCQ9C0C6 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CIPCQ9C0C6 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CIPCQ9C0C6 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CIPCQ9C0C6 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CIPCQ9C0C6 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CIPCQ9C0C6 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CIPCQ9C0C6 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CIPCQ9C0C6 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
CIPCQ9C0C6 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CIPCQ9C0C6 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CIPCQ9C0C6 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CIPCQ9C0C6 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
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