Protein–RNA interactions for Protein: Q96RQ1

ERGIC2, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERGIC2Q96RQ1 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.6 ms