Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 AC108157.1-201ENST00000510511 539 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.28□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 AL450344.2-201ENST00000455229 614 ntTSL 5 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 Y_RNA.55-201ENST00000362797 102 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 Y_RNA.684-201ENST00000516510 99 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 AC132825.8-201ENST00000640783 297 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 GXYLT1P1-201ENST00000446657 490 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 RPL17P35-201ENST00000432217 549 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 RNU6-964P-201ENST00000516524 69 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 AC090519.2-201ENST00000559034 655 ntTSL 5 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 AC097376.2-202ENST00000608345 433 ntTSL 3 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 AL391597.1-201ENST00000618707 694 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-0.3□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 RN7SKP5-201ENST00000517045 272 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
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