Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC1.56□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC1.56□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC1.56□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC1.54□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC1.54□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GABRA6Q16445 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.5 ms