Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
USF2Q15853 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
USF2Q15853 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
USF2Q15853 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
USF2Q15853 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
USF2Q15853 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC1.3□□□□□ -2.2
USF2Q15853 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
USF2Q15853 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
USF2Q15853 LINC00871-202ENST00000556071 554 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
USF2Q15853 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
USF2Q15853 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
USF2Q15853 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
USF2Q15853 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
USF2Q15853 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
USF2Q15853 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
USF2Q15853 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
USF2Q15853 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
USF2Q15853 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
USF2Q15853 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
USF2Q15853 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
USF2Q15853 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
USF2Q15853 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
USF2Q15853 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
USF2Q15853 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
USF2Q15853 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
USF2Q15853 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
USF2Q15853 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
USF2Q15853 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
USF2Q15853 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
USF2Q15853 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
USF2Q15853 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
USF2Q15853 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
USF2Q15853 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
USF2Q15853 RNU6-276P-201ENST00000516114 96 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
USF2Q15853 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
USF2Q15853 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
USF2Q15853 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
USF2Q15853 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
USF2Q15853 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
USF2Q15853 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.29□□□□□ -2.2
USF2Q15853 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
USF2Q15853 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
USF2Q15853 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
USF2Q15853 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
USF2Q15853 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
USF2Q15853 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
USF2Q15853 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
USF2Q15853 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
USF2Q15853 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
USF2Q15853 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
USF2Q15853 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
USF2Q15853 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC1.28□□□□□ -2.2
USF2Q15853 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
USF2Q15853 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
USF2Q15853 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
USF2Q15853 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
USF2Q15853 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
USF2Q15853 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
USF2Q15853 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC1.28□□□□□ -2.2
USF2Q15853 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
USF2Q15853 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
USF2Q15853 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
USF2Q15853 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
USF2Q15853 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
USF2Q15853 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
USF2Q15853 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
USF2Q15853 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
USF2Q15853 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
USF2Q15853 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
USF2Q15853 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
USF2Q15853 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
USF2Q15853 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
USF2Q15853 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
USF2Q15853 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
USF2Q15853 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
USF2Q15853 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
USF2Q15853 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
USF2Q15853 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
USF2Q15853 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
USF2Q15853 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
USF2Q15853 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
USF2Q15853 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
USF2Q15853 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
USF2Q15853 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
USF2Q15853 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
USF2Q15853 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
USF2Q15853 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
USF2Q15853 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
USF2Q15853 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
USF2Q15853 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
USF2Q15853 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
USF2Q15853 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
USF2Q15853 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
USF2Q15853 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
USF2Q15853 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
USF2Q15853 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
USF2Q15853 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
USF2Q15853 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
USF2Q15853 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
USF2Q15853 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
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