Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC-0.03□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 RNA5SP275-201ENST00000363936 118 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC-0.03□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AC010809.3-201ENST00000621310 641 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AC091132.5-202ENST00000587078 501 ntTSL 3 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 DSCR4-IT1-201ENST00000417138 424 ntTSL 5 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.04□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC-0.04□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC-0.05□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AC091814.1-201ENST00000545258 719 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
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