Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
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SIX1Q15475 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
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SIX1Q15475 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
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SIX1Q15475 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
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SIX1Q15475 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
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SIX1Q15475 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
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