Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
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COL19A1Q14993 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
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COL19A1Q14993 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
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COL19A1Q14993 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
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COL19A1Q14993 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
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COL19A1Q14993 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
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COL19A1Q14993 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
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COL19A1Q14993 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
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COL19A1Q14993 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
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COL19A1Q14993 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
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COL19A1Q14993 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
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COL19A1Q14993 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
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