Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
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