Protein–RNA interactions for Protein: Q14011

CIRBP, Cold-inducible RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBPQ14011 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 AL445435.1-201ENST00000604232 665 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC0.74□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.74□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 MTND4P21-201ENST00000453886 1357 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC0.74□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC0.74□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC0.74□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.74□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 MTCO3P43-201ENST00000440974 771 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC0.73□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC0.73□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC0.73□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC0.73□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 AL731537.2-201ENST00000561565 951 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC0.73□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC0.73□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC0.73□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.73□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.72□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.72□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 SPINK13-201ENST00000398450 509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.72□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC0.72□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC0.72□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CIRBPQ14011 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
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