Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.18□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 RNU6-152P-201ENST00000384037 107 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 HAUS1P3-201ENST00000523909 662 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.2□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC-0.2□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.2□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 AC069304.3-201ENST00000603938 1084 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 DSCR4-IT1-201ENST00000417138 424 ntTSL 5 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 Y_RNA.684-201ENST00000516510 99 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.21□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.22□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 Y_RNA.204-201ENST00000364112 102 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
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