Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CACNA1SQ13698 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CACNA1SQ13698 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CACNA1SQ13698 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CACNA1SQ13698 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
CACNA1SQ13698 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
CACNA1SQ13698 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CACNA1SQ13698 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CACNA1SQ13698 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CACNA1SQ13698 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CACNA1SQ13698 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CACNA1SQ13698 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CACNA1SQ13698 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
CACNA1SQ13698 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
CACNA1SQ13698 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC1.36□□□□□ -2.19
CACNA1SQ13698 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CACNA1SQ13698 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CACNA1SQ13698 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CACNA1SQ13698 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CACNA1SQ13698 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CACNA1SQ13698 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CACNA1SQ13698 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CACNA1SQ13698 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CACNA1SQ13698 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
CACNA1SQ13698 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
CACNA1SQ13698 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
CACNA1SQ13698 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CACNA1SQ13698 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CACNA1SQ13698 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC1.36□□□□□ -2.19
CACNA1SQ13698 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CACNA1SQ13698 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CACNA1SQ13698 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CACNA1SQ13698 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CACNA1SQ13698 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CACNA1SQ13698 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CACNA1SQ13698 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CACNA1SQ13698 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CACNA1SQ13698 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
CACNA1SQ13698 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CACNA1SQ13698 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC1.35□□□□□ -2.19
CACNA1SQ13698 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CACNA1SQ13698 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
CACNA1SQ13698 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
CACNA1SQ13698 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CACNA1SQ13698 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CACNA1SQ13698 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
CACNA1SQ13698 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CACNA1SQ13698 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CACNA1SQ13698 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
CACNA1SQ13698 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CACNA1SQ13698 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CACNA1SQ13698 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CACNA1SQ13698 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CACNA1SQ13698 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CACNA1SQ13698 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CACNA1SQ13698 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
CACNA1SQ13698 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CACNA1SQ13698 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CACNA1SQ13698 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
CACNA1SQ13698 MTATP6P14-201ENST00000455189 673 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CACNA1SQ13698 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CACNA1SQ13698 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
CACNA1SQ13698 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CACNA1SQ13698 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CACNA1SQ13698 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CACNA1SQ13698 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
CACNA1SQ13698 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CACNA1SQ13698 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
CACNA1SQ13698 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
CACNA1SQ13698 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
CACNA1SQ13698 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
CACNA1SQ13698 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
CACNA1SQ13698 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CACNA1SQ13698 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
CACNA1SQ13698 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CACNA1SQ13698 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CACNA1SQ13698 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CACNA1SQ13698 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CACNA1SQ13698 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CACNA1SQ13698 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CACNA1SQ13698 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CACNA1SQ13698 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CACNA1SQ13698 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
CACNA1SQ13698 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
CACNA1SQ13698 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CACNA1SQ13698 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CACNA1SQ13698 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
CACNA1SQ13698 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CACNA1SQ13698 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CACNA1SQ13698 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CACNA1SQ13698 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.33□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
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