Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CUL4AQ13619 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CUL4AQ13619 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
CUL4AQ13619 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CUL4AQ13619 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CUL4AQ13619 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
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