Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
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