Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 AP003168.1-201ENST00000530091 307 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 LINC01218-201ENST00000515150 481 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 MTND4LP25-201ENST00000570218 163 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRSQ13332 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.5 ms