Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NME3Q13232 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NME3Q13232 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NME3Q13232 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
NME3Q13232 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NME3Q13232 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
NME3Q13232 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
NME3Q13232 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NME3Q13232 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NME3Q13232 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NME3Q13232 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
NME3Q13232 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
NME3Q13232 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
NME3Q13232 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NME3Q13232 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NME3Q13232 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC2.19□□□□□ -2.06
NME3Q13232 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
NME3Q13232 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
NME3Q13232 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NME3Q13232 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
NME3Q13232 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NME3Q13232 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
NME3Q13232 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NME3Q13232 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
NME3Q13232 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
NME3Q13232 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NME3Q13232 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NME3Q13232 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NME3Q13232 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NME3Q13232 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NME3Q13232 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NME3Q13232 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NME3Q13232 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NME3Q13232 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
NME3Q13232 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
NME3Q13232 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
NME3Q13232 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NME3Q13232 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NME3Q13232 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NME3Q13232 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NME3Q13232 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NME3Q13232 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NME3Q13232 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
NME3Q13232 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NME3Q13232 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
NME3Q13232 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NME3Q13232 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NME3Q13232 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NME3Q13232 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NME3Q13232 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NME3Q13232 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
NME3Q13232 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NME3Q13232 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NME3Q13232 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NME3Q13232 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NME3Q13232 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NME3Q13232 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NME3Q13232 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
NME3Q13232 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
NME3Q13232 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NME3Q13232 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NME3Q13232 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NME3Q13232 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NME3Q13232 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NME3Q13232 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
NME3Q13232 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NME3Q13232 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NME3Q13232 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NME3Q13232 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NME3Q13232 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
NME3Q13232 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NME3Q13232 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
NME3Q13232 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
NME3Q13232 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NME3Q13232 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NME3Q13232 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NME3Q13232 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NME3Q13232 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
NME3Q13232 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
NME3Q13232 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NME3Q13232 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NME3Q13232 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NME3Q13232 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NME3Q13232 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
NME3Q13232 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NME3Q13232 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NME3Q13232 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NME3Q13232 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC2.17□□□□□ -2.06
NME3Q13232 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NME3Q13232 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NME3Q13232 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
NME3Q13232 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NME3Q13232 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NME3Q13232 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
NME3Q13232 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC2.17□□□□□ -2.06
NME3Q13232 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NME3Q13232 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
NME3Q13232 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NME3Q13232 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NME3Q13232 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
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