Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
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NR1H3Q13133 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
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NR1H3Q13133 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
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