Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC1.81□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
IFT88Q13099 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
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