Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
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FOXF1Q12946 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
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FOXF1Q12946 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.22□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
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