Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms