Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms