Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms