Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms