Protein–RNA interactions for Protein: Q53EZ4

CEP55, Centrosomal protein of 55 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP55Q53EZ4 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP55Q53EZ4 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms