Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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D130052B06RikQ3UW13 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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D130052B06RikQ3UW13 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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D130052B06RikQ3UW13 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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D130052B06RikQ3UW13 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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D130052B06RikQ3UW13 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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D130052B06RikQ3UW13 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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D130052B06RikQ3UW13 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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D130052B06RikQ3UW13 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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D130052B06RikQ3UW13 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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D130052B06RikQ3UW13 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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D130052B06RikQ3UW13 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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D130052B06RikQ3UW13 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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D130052B06RikQ3UW13 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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D130052B06RikQ3UW13 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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D130052B06RikQ3UW13 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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