Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SPHKAPQ2M3C7 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
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