Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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GABRA6Q16445 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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