Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NTRK3Q16288 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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