Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KCNH2Q12809 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KCNH2Q12809 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KCNH2Q12809 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KCNH2Q12809 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KCNH2Q12809 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
KCNH2Q12809 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KCNH2Q12809 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
KCNH2Q12809 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
KCNH2Q12809 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
KCNH2Q12809 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
KCNH2Q12809 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KCNH2Q12809 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KCNH2Q12809 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KCNH2Q12809 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
KCNH2Q12809 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
KCNH2Q12809 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
KCNH2Q12809 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
KCNH2Q12809 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.9
KCNH2Q12809 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
KCNH2Q12809 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
KCNH2Q12809 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNH2Q12809 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms