Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVK-24P63145 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVK-24P63145 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVK-24P63145 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVK-24P63145 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVK-24P63145 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVK-24P63145 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVK-24P63145 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVK-24P63145 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVK-24P63145 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVK-24P63145 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVK-24P63145 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVK-24P63145 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVK-24P63145 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVK-24P63145 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVK-24P63145 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVK-24P63145 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVK-24P63145 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVK-24P63145 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVK-24P63145 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVK-24P63145 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVK-24P63145 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVK-24P63145 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVK-24P63145 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVK-24P63145 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVK-24P63145 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVK-24P63145 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVK-24P63145 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVK-24P63145 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVK-24P63145 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVK-24P63145 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVK-24P63145 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVK-24P63145 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVK-24P63145 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVK-24P63145 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVK-24P63145 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVK-24P63145 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVK-24P63145 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVK-24P63145 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVK-24P63145 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVK-24P63145 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVK-24P63145 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVK-24P63145 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVK-24P63145 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVK-24P63145 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVK-24P63145 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVK-24P63145 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVK-24P63145 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVK-24P63145 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVK-24P63145 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVK-24P63145 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVK-24P63145 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
ERVK-24P63145 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms