Protein–RNA interactions for Protein: P56696

KCNQ4, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 4, humanhuman

Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ4P56696 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNQ4P56696 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms