Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms