Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CEP290O15078 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CEP290O15078 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP290O15078 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP290O15078 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP290O15078 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP290O15078 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP290O15078 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP290O15078 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP290O15078 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP290O15078 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP290O15078 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP290O15078 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP290O15078 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP290O15078 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP290O15078 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP290O15078 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP290O15078 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP290O15078 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP290O15078 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP290O15078 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP290O15078 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP290O15078 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP290O15078 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP290O15078 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP290O15078 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP290O15078 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP290O15078 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP290O15078 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP290O15078 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP290O15078 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP290O15078 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP290O15078 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP290O15078 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP290O15078 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP290O15078 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP290O15078 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP290O15078 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP290O15078 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP290O15078 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP290O15078 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP290O15078 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP290O15078 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP290O15078 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP290O15078 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP290O15078 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP290O15078 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CEP290O15078 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CEP290O15078 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CEP290O15078 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CEP290O15078 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CEP290O15078 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CEP290O15078 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CEP290O15078 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CEP290O15078 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CEP290O15078 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CEP290O15078 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CEP290O15078 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CEP290O15078 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CEP290O15078 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CEP290O15078 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CEP290O15078 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CEP290O15078 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CEP290O15078 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CEP290O15078 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CEP290O15078 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
CEP290O15078 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CEP290O15078 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
CEP290O15078 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CEP290O15078 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CEP290O15078 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CEP290O15078 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CEP290O15078 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CEP290O15078 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CEP290O15078 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CEP290O15078 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CEP290O15078 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CEP290O15078 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CEP290O15078 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CEP290O15078 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CEP290O15078 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CEP290O15078 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CEP290O15078 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CEP290O15078 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CEP290O15078 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CEP290O15078 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CEP290O15078 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CEP290O15078 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CEP290O15078 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CEP290O15078 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CEP290O15078 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CEP290O15078 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CEP290O15078 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CEP290O15078 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CEP290O15078 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CEP290O15078 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CEP290O15078 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CEP290O15078 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CEP290O15078 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CEP290O15078 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms